19 ноября 1561 года Святой Престол переименовал епархию Кароленсе в епархию Юкатана, присоединив к ней часть территории архиепархии Пуэблы. Новообразованная католическая епархия была присоединена к митрополии Мехико.

В следующие годы епархия Юкатана передала часть своей территории новым церковным структурам:

• 25 мая 1880 года - епархии Табаско;
• 23 июня 1891 года - епархии Антекера;
• 24 марта 1895 года - епархии Кампече;
• 23 мая 1970 года - Территориальной прелатуре Четумаль.

11 ноября 1906 года епархия Юкатана была возведена в ранг архиепархии.

Архиепархия Юкатана - архиепархия Римско-католической церкви с центром в городе Мерида, Мексика. В митрополию Юкатана входят епархии Кампече, Табаско и Территориальная прелатура Канкун-Четумаля. Кафедральным собором архиепархии Юкатана является церковь святого Ильдефонса.